MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Dehalobacter sp. CF chromosome

Total Repeats: 10445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018867	TGA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018867	TTTAT	2	10	1352	1361	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018867	AC	3	6	1370	1375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018867	TAA	2	6	1383	1388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018867	CAT	2	6	1404	1409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018867	CAGA	2	8	1440	1447	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018867	ATT	2	6	1483	1488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018867	TAC	3	9	1496	1504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018867	TAC	2	6	1508	1513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018867	TTA	2	6	1526	1531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018867	AGG	2	6	1581	1586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018867	ATG	2	6	2692	2697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018867	GCAAGT	2	12	4072	4083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018867	GCCA	2	8	4131	4138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018867	GTT	2	6	4163	4168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018867	TGAA	2	8	4204	4211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018867	GGGA	2	8	4254	4261	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018867	TAA	2	6	8691	8696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018867	ATG	2	6	8698	8703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018867	AGG	2	6	8740	8745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018867	T	7	7	11517	11523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018867	ATT	2	6	11552	11557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018867	TTGT	2	8	11561	11568	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018867	CTT	2	6	11599	11604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018867	TC	3	6	11633	11638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018867	CTG	2	6	11645	11650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018867	ATT	2	6	11755	11760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018867	GCGGA	2	10	11838	11847	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018867	TCC	2	6	11944	11949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_018867	CCA	2	6	11955	11960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_018867	T	8	8	11985	11992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018867	T	7	7	12074	12080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018867	GA	3	6	12110	12115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018867	ATA	2	6	12597	12602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018867	CGCAC	2	10	12637	12646	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_018867	CGC	2	6	12716	12721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_018867	GTT	2	6	12822	12827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018867	TAA	2	6	12863	12868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018867	CTT	2	6	12952	12957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018867	CAT	2	6	12964	12969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018867	CAT	2	6	13148	13153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018867	TA	3	6	13238	13243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018867	GAT	2	6	13253	13258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018867	AT	3	6	13445	13450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018867	TAT	2	6	13463	13468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018867	CCT	2	6	16502	16507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_018867	ATT	2	6	16513	16518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018867	A	6	6	16556	16561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018867	CCT	2	6	16830	16835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_018867	A	7	7	16863	16869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018867	ATT	2	6	16891	16896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018867	CGG	2	6	17009	17014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018867	GCC	2	6	17067	17072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_018867	TGC	2	6	17153	17158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018867	ATTT	2	8	17163	17170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018867	CAT	2	6	17217	17222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018867	TTG	2	6	17243	17248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018867	TGG	2	6	17255	17260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018867	ATT	2	6	17326	17331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018867	G	6	6	17352	17357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018867	TAA	2	6	17373	17378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018867	T	6	6	17387	17392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018867	T	6	6	17853	17858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018867	AAT	2	6	17905	17910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018867	A	6	6	17920	17925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018867	AT	3	6	17930	17935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018867	AAT	2	6	17936	17941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018867	A	6	6	17988	17993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018867	TTC	2	6	18075	18080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018867	TTTA	2	8	18081	18088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018867	AGG	2	6	18095	18100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018867	AGC	2	6	18126	18131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018867	A	6	6	18166	18171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018867	A	7	7	18211	18217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018867	T	6	6	18336	18341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018867	GTTAA	2	10	18355	18364	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018867	AAT	2	6	18395	18400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018867	ATGTT	2	10	18429	18438	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018867	TGT	2	6	18483	18488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018867	T	6	6	18718	18723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018867	TCG	2	6	18753	18758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018867	GAA	2	6	18796	18801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018867	AGG	2	6	18823	18828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018867	ACC	2	6	18890	18895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_018867	ATTTG	2	10	18900	18909	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018867	GGT	2	6	18913	18918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018867	TCA	2	6	19001	19006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018867	TAA	2	6	19143	19148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018867	ACT	2	6	19189	19194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018867	CTT	2	6	19425	19430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018867	T	6	6	19449	19454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018867	ATAAA	2	10	19518	19527	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018867	GGA	2	6	19773	19778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018867	CAA	2	6	22539	22544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018867	T	6	6	22571	22576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018867	CAAAAA	2	12	22582	22593	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_018867	AGG	2	6	22594	22599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018867	AGG	2	6	24331	24336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018867	AGG	2	6	25295	25300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018867	T	6	6	27573	27578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018867	AGG	2	6	27603	27608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018867	AAC	2	6	29008	29013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018867	AGG	2	6	29071	29076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018867	GGC	2	6	32493	32498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018867	AGG	2	6	32511	32516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018867	ATT	2	6	32517	32522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018867	TTG	2	6	46892	46897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018867	TCC	2	6	47185	47190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_018867	TA	3	6	47194	47199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018867	ATC	2	6	47214	47219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018867	TTA	2	6	47288	47293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018867	A	6	6	47293	47298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018867	ATA	2	6	47330	47335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018867	AAT	2	6	48592	48597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018867	T	6	6	48632	48637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018867	CA	3	6	50101	50106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018867	TG	3	6	50113	50118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018867	CAA	2	6	50144	50149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018867	GT	3	6	50163	50168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018867	ACC	2	6	50169	50174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_018867	A	6	6	50203	50208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018867	TAATG	2	10	50352	50361	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018867	TTA	2	6	50363	50368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018867	GCAAA	2	10	50391	50400	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018867	AGG	2	6	53885	53890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018867	AAC	2	6	57645	57650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018867	GGT	2	6	57653	57658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018867	GGA	2	6	58383	58388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018867	CCTG	2	8	63496	63503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018867	AT	3	6	63609	63614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018867	A	6	6	63653	63658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018867	AGG	2	6	63678	63683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018867	AGT	3	9	64313	64321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018867	A	6	6	64332	64337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018867	CCG	2	6	64357	64362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_018867	CAT	2	6	68265	68270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018867	TAA	2	6	68277	68282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018867	ATCCTC	2	12	68304	68315	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018867	CCT	3	9	68963	68971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_018867	TCAC	2	8	69326	69333	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018867	GAAA	2	8	69470	69477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018867	GCA	2	6	69481	69486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018867	T	6	6	69507	69512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018867	TGAA	2	8	70869	70876	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018867	TTA	2	6	70886	70891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018867	AAT	2	6	70930	70935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018867	AAT	2	6	70974	70979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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